Kyrönjoen yläosan tulvasuojeluhankkeen eri osille on useita lupapäätöksiä, joissa luvanhaltijana on valtio. Lupapäätöksissä on velvoite tarkkailla Kyrönjokeen johdettavien kuivatusvesien määrää ja laatua sekä rakentamisen ja pengerryspumppaamojen käytön vaikutusta Kyrönjoen tilaan. Lisäksi on tarkkailtava mm. vaikutuksia Kyrönjoen ja sen alapuolisen merialueen kala-, rapu- ja nahkiaiskantoihin ja kalastukseen sekä kalannousuun Malkakoskessa. Tämä on vuosiraportti vuoden 2021 tarkkailutuloksista.

Mustasaaren Skatilassa jokivesi oli vesieliöstölle hyvin hapanta (pH ≤5,5) vuoden 2021 runsasvetiseen aikaan keväällä huhtikuussa ja syksyllä marraskuussa. Kadmiumin ja nikkelin jokivesille asetetut kemiallisen tilan raja-arvot eivät ylittyneet Kyrönjoessa edes marras-kuussa happaman veden aikaan, joten niiden osalta kemiallinen tila oli hyvä. Kevättalvella 2021 vesi oli hyvin hapanta Liikapuron teko-järvessä (pH 4,8) samaan tapaan kuin vuotta aiemmin. Loppukesällä Pitkämön tekojärvessä oli hapen puutetta 10 metrin syvyydessä ja sitä syvemmällä, mikä aiheutti sisäistä ravinnekuormitusta.

Pengerryspumppaamojen kautta Kyrönjokeen johdetun kuivatusveden määrä oli suurin huhtikuussa, jolloin pumppausmäärät olivat moninkertaisia muihin kuukausiin nähden. Syksyllä pumpattiin eniten lokakuussa. Kuivatusvesi oli hyvin hapanta suurimman osan vuodesta. Pahin tilanne oli Pajuluoman pumppaamolta johdetussa kuivatusvedessä, jossa pH oli 3,2–3,8.

Poikasnuottasaaliissa vuonna 2021 ahven oli Kitinojan valtalaji tavanomaiseen tapaan, mutta myös lahnan tai pasurin osuus oli suuri niin kuin muillakin paikoilla. Vuonna 2021 kuoriutuneita kuhia tavattiin vain Ilmajoen Peuralasta. Vuoden 2021 sähkökalastuksissa Perttilänkoskesta saatiin yksi kookas noin 3 kg painoinen taimen. Sähkökalastusten uutena saalislajina oli ankerias, jota saatiin Seinä-joen vähävetisestä uomasta kaksi yksilöä. Koeravustuksissa ei saatu rapuja. Koeverkoissa salakan yksikkösaaliit olivat vuonna 2021 suurempia kuin vuosiin ja lisäksi pasuria esiintyi poikkeuksellisesti Kitinojalla ja Peuralassa. Kyrönjoen edustan Österfjärdenillä kappalemääräisestä saaliista peräti 70 % oli pasuria ja massamääräisestä lähes puolet. Nahkiaisen toukkia ei löydetty vuonna 2021.