Viemäröintiohjelmassa esitetään yleiset periaatteet ja kriteerit viemäröinnin toteuttamiselle ja laajentamiselle haja-asutusalueilla. Nämä linjaukset on tarkoitettu kaikille vesihuollosta vastaaville tahoille otettavaksi huomioon arvioitaessa verkostoratkaisujen tarvetta ja tarkoituksenmukaisuutta verrattuna jätevesihuollon järjestämiseen kiinteistökohtaisin ratkaisuin. Viemäröintiohjelmassa esitetään myös suunnitelma valtion tuen suuntaamiseksi haja-asutusalueiden viemäriverkostojen laajentamiseen sekä siirtoviemärihankkeisiin.

Ohjelman aikajänne kattaa vuoteen 2016 ulottuvan hajajätevesiasetuksen voimaanpanon siirtymäkauden ja samalle ajanjaksolle osuvan meneillään olevan vesienhoidon suunnittelukauden. Viemäröintiohjelmalla on siten huomattava merkitys vesienhoitosuunnitelmien toteutumisen edistämisessä. Ohjelma perustuu pääosin elinkeino-, liikenne- ja ympäristökeskuksilta ja kunnilta saadun tiedon pohjalta laadittuun tarveselvitykseen haja-asutusalueiden viemäröinnin nykytilasta ja kehittämistarpeista sekä suunnitteilla olevista siirtoviemärihankkeista.

Ohjelman tavoitteena on selventää valtion vesihuoltotoimenpiteisiin kohdentaman tuen kokonaismäärän alueellista jakautumista ELY-keskuksittain, sillä vain osa tarveselvityksen hankkeista voi toteutua valtion tuella. Ohjelmassa esitetyt lähivuosien tukirahoitusta koskevat suunnitelmat ovat suuntaa-antavia, sillä valtion tuen määrä tarkentuu vasta vuosittain talousarviomenettelyssä ja myös tarpeet alueittain voivat muuttua ohjelmakauden edetessä. Ohjelmalla pyritään hyvän yhteiskunnallisen vaikuttavuuden saavuttamiseen yhdyskuntajätevesien puhdistamistoimia tehostettaessa.